В Питере хорошо квартиру посуточно снимать. Предложений навалом - если что, могу подсказать тётушку, у которой уже несколько раз останавливался.
Лучший хостел, пожалуй, Пилау - около пяти углов находится и в целом приятный вроде.
http://www.hostelpilau.ru/ раньше места без проблем бронировали.

Из окрестностей, если на промышленность ориентироваться, однозначно лучше Кронштадта ничего не придумать :) Летом туда оптимально добираться рано утром от набережной у финляндского вокзала на метеоре, ну и часов до 8-9 этот метеор туда-сюда курсирует.

Ну а по Москве даже не знаю что сказать - ничего не приходит в голову. Разве что на Винзаводе, пожалуй, я ничего интересного не нашёл. Хотя архитектура там окей ))